Por qué es un pronombre interrogativo que se escribe separado y con tilde. Se usa cada vez que se hace una pregunta, ya sea directa o indirecta:
¿Por qué llegaste tarde? No sé por qué no vino.
Porque es una conjunción causal que se escribe junto y sin tilde. Se utiliza al responder una pregunta o expresar alguna causa:
Porque había mucho tráfico. No vino porque estaba enfermo.
Porqué es un nombre que se escribe junto y con tilde. Es sinónimo o significa lo mismo que razón, motivo, causa, etc:
Desconozco el porqué de su ausencia.
